一种基于CNN-Attention-GNN模型的多肽结构鉴定方法及其应用

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一种基于CNN-Attention-GNN模型的多肽结构鉴定方法及其应用
申请号:CN202410727769
申请日期:2024-06-06
公开号:CN118298928B
公开日期:2024-11-26
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基于CNN‑Attention‑GNN模型的多肽结构鉴定方法及其应用,方法包括:对收集的多肽质谱信息进行预处理,建立标准化多肽数据集;设计并训练基于CNN‑Attention‑GNN架构模型,模型包括:肽离子峰鉴定层用于识别质谱峰中的碎片离子;节点嵌入层则通过卷积神经网络和自注意力机制进行特征提取,以捕捉有意义的信息;图神经网络层负责捕捉质谱峰中碎片离子之间的复杂关系,以提升模型推断的准确性;输出层通过Softmax和全连接层等操作生成最终的多肽序列;最后,将待测质谱数据输入训练好的模型,生成预测结果。本发明通过结合CNN网络、自注意力机制、图神经网络以及多肽谱峰间的相关联系,为生物领域的研究和生物活性肽的发展提供坚实基础。
技术关键词
多肽结构 离子 数据集构建方法 节点 注意力机制 模型构建方法 消息更新 更新方法 序列 邻居 质谱仪 基础 关系 生物 网络
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