摘要
本发明公开了一种用于单细胞测序数据的缺失值插补方法,涉及单细胞RNA测序数据测序技术领域。本发明包括如下步骤:S1、构建原始基因表达矩阵V,对V进行归一化处理而后分别进行两次遮蔽操作,得到原始遮蔽基因矩阵X1和X2,而后,基于X1和X2分别生成细胞图A1和A2;S2、构建图对比学习重构网络,得到插补后的基因表达矩阵;S3、构建图对比学习重构网络的总损失;S4、基于总损失L训练图对比学习重构网络;S5、将单细胞测序数据按照步骤S1获取X1、X2、A1和A2,而后将其输入至模型中,前向传播一次,得到插补后的基因表达矩阵。本申请得到的插补后的基因表达矩阵,在细胞聚类、细胞轨迹重建任务中都有较佳表现。
技术关键词
缺失值插补方法
基因
矩阵
重构
网络结构
模块结构
数据
更新模型参数
KNN算法
非线性
测序技术
元素
训练集
聚类
轨迹
关系