一种用于单细胞测序数据的缺失值插补方法

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一种用于单细胞测序数据的缺失值插补方法
申请号:CN202410748379
申请日期:2024-06-12
公开号:CN118335191B
公开日期:2024-09-13
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种用于单细胞测序数据的缺失值插补方法,涉及单细胞RNA测序数据测序技术领域。本发明包括如下步骤:S1、构建原始基因表达矩阵V,对V进行归一化处理而后分别进行两次遮蔽操作,得到原始遮蔽基因矩阵X1和X2,而后,基于X1和X2分别生成细胞图A1和A2;S2、构建图对比学习重构网络,得到插补后的基因表达矩阵;S3、构建图对比学习重构网络的总损失;S4、基于总损失L训练图对比学习重构网络;S5、将单细胞测序数据按照步骤S1获取X1、X2、A1和A2,而后将其输入至模型中,前向传播一次,得到插补后的基因表达矩阵。本申请得到的插补后的基因表达矩阵,在细胞聚类、细胞轨迹重建任务中都有较佳表现。
技术关键词
缺失值插补方法 基因 矩阵 重构 网络结构 模块结构 数据 更新模型参数 KNN算法 非线性 测序技术 元素 训练集 聚类 轨迹 关系
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