基于非冗余德布鲁因图的DNA存储数据重建方法及系统

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基于非冗余德布鲁因图的DNA存储数据重建方法及系统
申请号:CN202410768990
申请日期:2024-06-14
公开号:CN118782143A
公开日期:2024-10-15
类型:发明专利
摘要
本发明公开了基于非冗余德布鲁因图的DNA存储数据重建方法及系统,涉及DNA存储技术领域;包括将莱文斯坦距离小于等于设定阈值的DNA序列划分到同一个聚类子图;将DNA序列之间具有最小莱文斯坦距离的节点连边,度数最大的节点代表该聚类子图中的骨干序列;将骨干序列作为测序数据对齐的模板序列,构造束搜索图;根据束搜索算法进行错误纠正和筛选最佳优选路径,得到共识序列;构造非冗余德布鲁因图;删除权值低于设定阈值的边所连接的节点;根据非冗余德布鲁因图中节点信息以及共识序列进行路径选择;路径选择后的序列即为重建后的序列。本发明能够在保持数据完整性的同时,尽可能减小对存储密度的影响,从而实现更为高效和可靠的DNA数据存储。
技术关键词
数据重建方法 节点 DNA序列 冗余 搜索算法 DNA存储技术 滑动窗口 数据重建系统 模块 模板 代表 频率 数据存储 索引 关系
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