基因标志物在多癌种早筛中的应用、早筛模型构建方法以及检测装置

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基因标志物在多癌种早筛中的应用、早筛模型构建方法以及检测装置
申请号:CN202410791117
申请日期:2024-06-19
公开号:CN118366547B
公开日期:2024-08-23
类型:发明专利
摘要
本发明涉及一种基因标志物在多癌种早筛中的应用、早筛模型构建方法以及检测装置。本发明对血浆样本cfDNA进行WGS低深度测序,使用高通量测序结果分析各癌种cfDNA片段六种差异特征,包括基因组范围片段长度覆盖分布,染色体各长短臂上片段长度分布,1MB窗口片段拷贝数变化,核小体覆盖模式,片段甲基化模式和突变频谱,利用卷积神经网络进行训练建模,实现在低测序深度下对多个癌肿的高特异性高敏感性的精准早期检测,再利用广义线性模型,梯度提升,随机森林,深度学习,和极端梯度提升五种算法分别进行训练建模,广义线性模型进行二次集合训练构建多特征算法整合,实现对多癌种的组织溯源检测的目的。
技术关键词
转录因子 标志物 位点 染色体 广义线性模型 分类器模型 特征值 梯度提升模型 拷贝数 卷积神经网络模型 模型构建方法 深度学习神经网络模型 曲线 模式 多特征算法 数据 代表 随机森林 线性回归模型 核苷酸
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