摘要
一种基于知识图谱的癌症药物反应预测方法,属于生物信息技术领域。为了解决现有癌症药物反应预测准确率低且不具备可解释性的问题,本发明基于细胞系、药物、组织与蛋白质关系的异构数据构建知识图谱,再利用元路径生成了多个子知识图谱,然后采用基于多水平注意力机制的层次传播策略在子知识图谱上提取和融合高阶邻居信息,以更新药物和细胞系的嵌入表示;最后通过对比学习引入药物细胞系对相似性信息后,再利用习得的细胞系药物嵌入预测癌症细胞系对药物的敏感程度。本发明用于癌症药物反应预测。
技术关键词
细胞系
药物相似性网络
多头注意力机制
实体
邻居
数据
构建知识图谱
关系
基因
生物信息技术
组织
度量
重构药物
拷贝数
层级
指纹