用于虚拟筛选的蛋白配体亲和力预测方法、系统、电子设备及存储介质

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用于虚拟筛选的蛋白配体亲和力预测方法、系统、电子设备及存储介质
申请号:CN202410831073
申请日期:2024-06-26
公开号:CN118782136A
公开日期:2024-10-15
类型:发明专利
摘要
本发明属于生物信息结合深度学习的技术领域,更具体地,涉及一种用于虚拟筛选的蛋白配体亲和力预测方法、系统、电子设备及存储介质。所述方法包括:对PDBbind数据集中的蛋白‑配体复合物样本进行预处理,构建训练样本集;构建亲和力预测模型,并利用训练样本集训练亲和力预测模型;分别获取蛋白和配体的pdb格式或pdbqt格式的结构文件,通过AutoDock分子对接进行蛋白和配体对接,得到目标蛋白‑配体复合物,并对目标蛋白‑配体复合物进行预处理;将预处理后的目标蛋白‑配体复合物输入训练后的亲和力预测模型中,生成蛋白‑配体亲和力预测结果。本发明提高了蛋白‑配体亲和力预测的精度和效率。
技术关键词
亲和力预测模型 配体 复合物 蛋白 训练样本集 编码 格式 机器可读存储介质 存储器存储指令 电子设备 带电荷 数据获取模块 分子 预测系统
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