一种临床隐球菌高致病力相关的lncRNA检测方法和应用

本发明公开了一种地域性临床隐球菌特异性遗传性状lncRNA的检测和应用，所属分子生物学技术领域。发明人通过收集全国重要省市收集临床分离株、环境分离株进行全基因组测序，进一步运用GWAS，配合多元线性回归、逻辑回归等将基因与表型进行关联性分析，挖掘与地域菌株高度相关的核酸序列特征，筛选得到地域遗传性状534个，新型毒力因子126个，包括23个长链非编码RNA。通过进一步的筛选得到1个lncRNA的突变位点与临床隐球菌高致病力性状相关，该突变位点位于如SEQ ID NO.1所示的隐球菌lncRNA基因的第214位碱基上，该位点为C>T单碱基突变。该位点的突变与高致病力性状的隐球菌紧密相关，采用简便的基因分型技术检测该位点，便可在早期精准诊断患者携带的隐球菌是否是高致病力菌株，明确临床用药量，灵敏性好，特异度高，应用前景广阔，具有重要价值。