摘要
本发明涉及DNA甲基化标志物筛选技术领域,特别是涉及一种基于DNA甲基化修饰的血浆PCR检测试剂盒标志物位点的筛选方法。其包括以下具体步骤:S1、收集用于位点筛选的甲基化数据,并进行预处理;S2、癌与癌旁组织中甲基化水平的差异分析,筛选差异甲基化CpG位点;S3、对血浆背景甲基化水平的筛选,剔除易受到血浆背景甲基化干扰的位点;S4、候选位点的基因组位置注释,选择位于基因转录起始位点附近的位点作为候选标志物;S5、候选标志物与CpG岛相对位置的分析,筛选位于CpG岛的候选位点;S6、候选标志物位点所在基因的生物学功能与通路注释分析。通过本发明方法筛选出标志物点位准确度高,所制成的血浆PCR检测试剂盒的良好性能。
技术关键词
PCR检测试剂盒
标志物
筛选方法
基因转录起始位点
探针
分类模型构建
样本
分类器模型
组织
淋巴细胞
线性回归方程
梯度下降算法
机器学习方法
数据
筛选技术
回归算法
基因芯片