一种基于DNA甲基化修饰的血浆PCR检测试剂盒标志物位点的筛选方法

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一种基于DNA甲基化修饰的血浆PCR检测试剂盒标志物位点的筛选方法
申请号:CN202410851294
申请日期:2024-06-28
公开号:CN118773316A
公开日期:2024-10-15
类型:发明专利
摘要
本发明涉及DNA甲基化标志物筛选技术领域,特别是涉及一种基于DNA甲基化修饰的血浆PCR检测试剂盒标志物位点的筛选方法。其包括以下具体步骤:S1、收集用于位点筛选的甲基化数据,并进行预处理;S2、癌与癌旁组织中甲基化水平的差异分析,筛选差异甲基化CpG位点;S3、对血浆背景甲基化水平的筛选,剔除易受到血浆背景甲基化干扰的位点;S4、候选位点的基因组位置注释,选择位于基因转录起始位点附近的位点作为候选标志物;S5、候选标志物与CpG岛相对位置的分析,筛选位于CpG岛的候选位点;S6、候选标志物位点所在基因的生物学功能与通路注释分析。通过本发明方法筛选出标志物点位准确度高,所制成的血浆PCR检测试剂盒的良好性能。
技术关键词
PCR检测试剂盒 标志物 筛选方法 基因转录起始位点 探针 分类模型构建 样本 分类器模型 组织 淋巴细胞 线性回归方程 梯度下降算法 机器学习方法 数据 筛选技术 回归算法 基因芯片
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