一种油菜籽含油量与蛋白质含量全基因组选择方法

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一种油菜籽含油量与蛋白质含量全基因组选择方法
申请号:CN202410878551
申请日期:2024-07-02
公开号:CN118711666A
公开日期:2024-09-27
类型:发明专利
摘要
本发明提供了一种油菜籽含油量与蛋白质含量全基因组选择方法,涉及油菜遗传育种技术领域,该方法包括:对油菜样本进行全基因组重测序操作,得到重测序数据;对重测序数据进行数据清洗,得到清洗数据;对清洗数据进行变异呼叫和过滤筛选,得到第一变异点位;对第一变异点位进行全基因组关联分析,得到第二变异点位;将第二变异点位输入至多个预设的学习模型中,得到多个预测结果,并通过对比多个预测结果,选取预测模型;对预测模型进行优化,得到优化模型;将第二变异点位输入至优化模型中,得到最终预测结果。该方法提升了对多基因控制复杂性状及低遗传力性状的选择效率和对油菜基因组预测的准确率。
技术关键词
全基因组关联分析 皮尔逊相关系数 LightGBM模型 XGBoost模型 混合线性模型 遗传育种技术 数据 SVR模型 超参数 样本 算法
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