一种基于全基因组SNP信息的华西牛基因组选配方法及应用

本发明提供了一种基于全基因组SNP信息的华西牛基因组选配方法及应用，属于动物育种技术领域。要解决的是现有肉牛育种群多世代基因组选择后造成的近交水平上升、遗传进展下降的问题。本发明的具体步骤如下：步骤一，从待配华西牛个体中提取DNA进行基因分型，并且对数据进行处理和质量控制；步骤二，进行基因型数据填充，得到高密度芯片数据；步骤三，计算加性亲缘关系矩阵，利用GBLUP得到待配华西牛群体五个重要经济性状的基因组估计育种值，再计算个体的综合选择指数；步骤四，采用遗传算法构建群体最优交配组合列表。本发明大幅度节约育种成本，降低后代群体近亲繁殖水平，缩短育种进程，具有良好的应用前景和经济效益。