一种高粱高密度全基因组SNP芯片及其应用

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一种高粱高密度全基因组SNP芯片及其应用
申请号:CN202410956412
申请日期:2024-07-17
公开号:CN118792298A
公开日期:2024-10-18
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种高粱高密度全基因组SNP芯片及其应用,属于高粱分子遗传育种领域。所述芯片的基因分型点位包括定位于酒用高粱参考基因组HYZ‑T2T上的52074个SNP位点,这些SNP均匀分布在高粱基因组的10条染色体上,SNP的平均密度为每100Kb有7个SNP,所述SNP在所有测试品种中均具有丰富的多态性。所述芯片的SNP标记包含45506个在基因组上均匀覆盖的背景位点、5059个功能基因位点、231重要农艺性状的关联位点和1278个贵州酒用高粱群体的特异性位点,能够更有效地用于高粱高密度遗传图谱构建、高粱种质资源亲缘关系鉴定、高通量基因分型、QTL定位和全基因组关联分析等。
技术关键词
高粱 位点 亲缘关系鉴定 探针 芯片 高通量基因分型 高密度遗传图谱 遗传多样性分析 性状关联分析 种质资源 分子标记辅助 染色体
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