摘要
本发明公开了一种高粱高密度全基因组SNP芯片及其应用,属于高粱分子遗传育种领域。所述芯片的基因分型点位包括定位于酒用高粱参考基因组HYZ‑T2T上的52074个SNP位点,这些SNP均匀分布在高粱基因组的10条染色体上,SNP的平均密度为每100Kb有7个SNP,所述SNP在所有测试品种中均具有丰富的多态性。所述芯片的SNP标记包含45506个在基因组上均匀覆盖的背景位点、5059个功能基因位点、231重要农艺性状的关联位点和1278个贵州酒用高粱群体的特异性位点,能够更有效地用于高粱高密度遗传图谱构建、高粱种质资源亲缘关系鉴定、高通量基因分型、QTL定位和全基因组关联分析等。
技术关键词
高粱
位点
亲缘关系鉴定
探针
芯片
高通量基因分型
高密度遗传图谱
遗传多样性分析
性状关联分析
种质资源
分子标记辅助
染色体
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