一种低深度全基因组测序数据的基因型填充计算方法

本申请公开了一种低深度全基因组测序数据的基因型填充计算方法，通过获取待填充的二倍体低深度测序样本；根据预设的远祖单倍体数目和栅格数目，采用隐马尔可夫模型的前向后向算法，建立隐马尔可夫模型；根据所述隐马尔可夫模型，对所述待填充的测序样本进行填充，即推测待填充样本中缺失位点处的基因型。本申请实施例中对二倍体低深度群体基因型填充算法中的马尔科夫链前向后向算法进行优化，从而对待填充的测序基因序列进行快速准确的填充，以减少运算量及运行内存空间需求。