基于改进粒子群算法的蛋白质吸附构型优化方法

本发明公开了一种基于改进粒子群算法的蛋白质吸附最优构型的优化方法，主要包括如下流程：首先下载蛋白质的结构文件以及蛋白质将要吸附的界面的结构文件，同时生成相对应的力场文件作为输入文件进行吸附体系的构建。接下来程序会自动构建相对应的蛋白质在界面上的吸附体系，同时会构建由28个粒子构成的粒子群去探索蛋白质在吸附界面上的最优吸附构型，首先会初始化28个随机离子的速度和位置信息，然后通过粒子的动态演化找到当前的最优解，在每一次的迭代中，粒子通过跟踪两个值Pi和Pg来更新粒子的信息。当前的粒子群最优适应值达到收敛精度时，粒子群停止迭代并输出全局最优的吸附构型。