一种基于图卷积神经网络的小分子虚拟筛选方法及系统

本发明涉及一种基于图卷积神经网络的小分子虚拟筛选方法及系统，首先获取目标靶点的活性化合物及诱饵化合物数据，并对获取数据进行预处理，其次构建图卷积神经网络模型并使用预处理后的数据集对模型进行训练和评估，随后使用训练好的图卷积神经网络模型对化合物数据库中获取的小分子化合物数据进行打分，保留预测得分高的小分子化合物，最后获取目标靶点的已知药物分子数据，将预测得分高的小分子化合物与已知药物分子进行化合物相似性搜索，得到与已知药物分子存在相似性的小分子化合物。与现有技术相比，本发明利用了虚拟筛选，加速药物研发的过程，减少实验成本，并在此基础上结合化合物相似性搜索，进一步提高筛选准确度，缩小了筛选结果范围。