一种柳树全基因组40K SNP液相芯片及其应用

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一种柳树全基因组40K SNP液相芯片及其应用
申请号:CN202411097961
申请日期:2024-08-12
公开号:CN119177306A
公开日期:2024-12-24
类型:发明专利
摘要
本发明为了以低成本、高效、简单的手段解决柳树育种难题,提供一种柳树全基因组40K SNP液相芯片,包括柳树40K位点探针混合液和杂交捕获试剂,所述柳树40K位点探针混合液包括柳树SNP背景位点探针和柳树SNP关联位点探针,每个位点至少2根捕获探针。该液相芯片用于柳树遗传多样性分析、分子遗传图谱构建、全基因组关联分析、品种真实性鉴定、分子标记辅助选择育种、全基因组选择育种,应用在柳树叶片检出试验中,对检出情况进行了统计,芯片共40188个位点,在16个样本原始SNP位点中平均检出率为97.39%,对16个样本数据合并进行统计后,位点检出率达99.9%,该方法大大节省了样本检测的服务周期,提高了柳树的育种效率。
技术关键词
位点 全基因组关联分析 遗传多样性分析 分子标记辅助 液相 混合液 捕获探针 芯片 核苷酸 染色体 重复序列 字母 样本 图谱 生物素 试剂盒
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