基于自适应往返增强采样预测结合自由能的方法及系统

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基于自适应往返增强采样预测结合自由能的方法及系统
申请号:CN202411100166
申请日期:2024-08-12
公开号:CN118983002A
公开日期:2024-11-19
类型:发明专利
摘要
本发明涉及药物设计技术领域,公开了基于自适应往返增强采样预测结合自由能的方法及系统,包括以下具体步骤:构建基础自由能扰动参数和自适应往返增强采样参数文件;切分自由能扰动过程的窗口方案;对第一部分的窗口进行1次正向分子动力学模拟和往返分子动力学模拟,进行往返增强采样;动态评估最后1次正向分子动力学模拟的收敛性,若判断不收敛则重新进行往返分子动力学模拟,若判断收敛则进行下一部分窗口的往返增强采样;基于窗口模拟计算结合自由能。本发明解决了现有技术计算结合自由能成本高的问题,且具有能够提高采样效率并减少计算浪费,加速药物设计技术领域对药物‑靶标亲和力的预测的特点。
技术关键词
分子 药物设计技术 动态 参数 监测模块 序列 控制模块 指标 数据 分段 基础 亲和力 数值 算法 靶标 级联 端点 输出端
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