基于环挤压模型中转录因子序列预测CTCF染色质环的方法

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基于环挤压模型中转录因子序列预测CTCF染色质环的方法
申请号:CN202411103532
申请日期:2024-08-13
公开号:CN119207565A
公开日期:2024-12-27
类型:发明专利
摘要
本发明涉及一种基于环挤压模型中转录因子序列预测CTCF染色质环的方法。它解决了现有技术中染色质环预测方法可解释性有限且预测不准确的问题。它包括S1、构建数据集;S2、关键转录因子序列转化;S3、建立基于关键转录因子序列的CTCF染色质环分类模型;S4、模型评估。本发明的优点在于:仅用关键转录因子序列作为输入,能够实现对CTCF染色质环的预测。创新地将转录因子结合顺序编码为转录因子序列,利用自然语言的预训练BERT模型,解码转录因子序列,实现对CTCF染色质环的预测,提高预测准确率的同时,增强预测模型的可解释性。
技术关键词
转录因子 序列 建立分类模型 垃圾桶 数据 BERT模型 自然语言 样本 坐标 定义 染色体 分类器 训练集 阶段 终点 位点 解码 逻辑 标签 曲线
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