一种融合全局和局部信息的联合虚拟筛选方法

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一种融合全局和局部信息的联合虚拟筛选方法
申请号:CN202411112493
申请日期:2024-08-14
公开号:CN119152976A
公开日期:2024-12-17
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种融合全局和局部信息的联合虚拟筛选方法,属于人工智能药物发现领域,包括以下步骤:首先准备待筛选靶标的活性和非活性分子的SMILES数据集以及随机分子的SMILES数据集;然后选用融合了子结构和物化属性信息的编码方式,分别训练GBDT的全局模型和局部模型;接着使用全局模型预测待筛选数据集,选取预测概率高的TopK1分子;并使用局部模型预测TopK1分子,选取TopK1分子中全局模型预测概率和局部模型预测概率的乘积高的TopK2分子;最后训练预测IC50值的GBDT的回归模型,根据预测值对TopK2分子进行重排序。本发明极大地减少了模型预测的分子数量,具有快速的筛选速度和高筛选精度,适用于小规模和超大规模的虚拟筛选,显著地降低了药物研发的成本和时间。
技术关键词
虚拟筛选方法 分子 融合全局 超参数 二分类模型 靶标 样本 数据标签 训练集 计算机存储介质 编码策略 超大规模 指纹 指标 处理器 算法 小规模
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