一种基于结合模式分析的药物分子虚拟筛选方法

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推荐专利
一种基于结合模式分析的药物分子虚拟筛选方法
申请号:CN202411371998
申请日期:2024-09-29
公开号:CN119400280B
公开日期:2025-10-17
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基于结合模式分析的药物分子虚拟筛选方法,属于人工智能药物发现领域;使用PLIP计算待筛选靶标和小分子之间的结合模式,进行编码,并利用DBSCAN算法对结合模式聚类,识别相似结合模式的化合物群体;在筛选阶段,引入两项关键指标:根据氢键补偿数和AutoDock Vina得分形成能量指标,并根据结合模式中相关残基与关键位点alpha碳原子的相关性作为活性指标,用于评估靶标与小分子之间的结合稳定性和特征活性,对候选分子进行多目标前沿分析;本发明方法显著提高了虚拟筛选的效率和精度,增强了对分子间相互作用的细致分析,适用于小规模和大规模的分子筛选,降低药物研发的成本和时间,丰富虚拟筛选结果的多样性,为后续实验提供更具潜力的候选分子。
技术关键词
虚拟筛选方法 靶标 药物 小分子化合物 复合物 模式 DBSCAN算法 分子间相互作用 皮尔逊相关系数 位点 计算机存储介质 矩阵 指标 程序 蛋白 处理器 聚类 小规模 存储器
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