一种基于序列比对分析算法来精准构建耶氏肺孢子菌特异性引物探针组合的方法和应用

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一种基于序列比对分析算法来精准构建耶氏肺孢子菌特异性引物探针组合的方法和应用
申请号:CN202411435664
申请日期:2024-10-15
公开号:CN119694389A
公开日期:2025-03-25
类型:发明专利
摘要
本发明属于病原微生物检测领域,具体公开了一种基于序列比对分析算法来精准构建耶氏肺孢子菌特异性引物探针组合的方法和应用;所述方法包括以下步骤:1)通过生物信息学分析获得耶氏肺孢子菌候选的物种特异性的基因片段;2)在候选基因片段中排除在其他微生物及宿主人的基因组中的相似性序列,筛选到耶氏肺孢子菌的物种特异性的基因片段;3)针对物种特异性的基因片段的稳定性和保守性,设计特异性的引物探针组合;本发明还公开了实现快速准确地鉴定目的病原菌的TaqMan探针检测流程的方法以及优选的特异性引物探针组合,利用本发明所述的引物探针组合进行检测具有准确、方便、快捷、低成本的优势,适于在相应的科研和临床场景中进行应用推广。
技术关键词
耶氏肺孢子菌 引物探针组合 基因 TaqMan探针法 荧光PCR仪器 序列 试剂盒 肺泡灌洗液 样本 临床场景 标签 待检样品 封板膜 曲线 算法 真菌
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沪ICP备2023015588号