摘要
本发明提供了一种新型靶向CD13的PET分子探针及其制备方法与应用,属于医药技术领域,基于计算机辅助药物设计改造环肽,首先同源模建环肽cCNGRCG与Homo sapiens CD13蛋白,再预测和筛选待改造环肽与Homo sapiens CD13复合物结构,最后进行分子动力学模拟及结合自由能计算,包括六种设计策略来提高环肽与蛋白的亲和力:N端连接linker会使活性降低;C端连接linker以保持环肽的活性;利用硫醚基,醚基和四元环结构稳定多肽构象优化;环肽的Arg与N350形成氢键,且靠近R363可能有电荷排斥,可尝试氨基酸点突变提高亲和力;氨基酸多突变和侧链延长。
技术关键词
计算机辅助药物设计
复合物结构
分子
探针
前体化合物
68Ga发生器
耦合算法
蛋白
立方体盒子
环肽化合物
软件
梯度方法
亲和力
去离子水
多肽
模拟系统
温度恒定
硫醚
三维结构