基于k-mers算法的独特序列引物设计方法、系统及存储介质

AITNT
正文
推荐专利
基于k-mers算法的独特序列引物设计方法、系统及存储介质
申请号:CN202411460336
申请日期:2025-01-10
公开号:CN119479806A
公开日期:2025-02-18
类型:发明专利
摘要
本发明涉及引物设计技术领域,更具体地,涉及基于k‑mers算法的独特序列引物设计方法、系统及存储介质。其中方法包括:取待监测物种信息,根据监测物种信息得到非容忍组、容忍组以及参考组;其中非容忍组为干扰物种的全线粒体基因组序列;参考组为待监测物种的全线粒体基因组序列;容忍组为待监测物种的其他种全线粒体基因组序列;参考组设置参数;根据k‑mers的长度对非容忍组、容忍组以及参考组进行截取,得到非容忍组k‑mers片段、容忍组k‑mers片段以及参考组k‑mers片段;然后进行比对,得到独特区域序列;通过将待监测物种的其他种全线粒体基因组序列设置为容忍组;从而使得在设计特定物种引物时减少了单个全线粒体基因组测序时可能存在的碱基误差,增加针对监测物种长片段序列引物设计的特异性。
技术关键词
引物设计方法 序列设计引物 算法 引物设计技术 计算机内存 参数 设计系统 链表 输入模块 输出模块 键值 频率 基因 处理器 误差 程序
添加客服微信openai178,进AITNT官方交流群
驱动智慧未来:提供一站式AI转型解决方案
沪ICP备2023015588号