摘要
本发明涉及一种确定生物体病状的基因标志物、检测模型的构建方法和检测装置,所述确定生物体病状的基因标志物是由参考基因组上的k个连续的碱基序列构成,所述碱基序列是由游离脱氧核糖核酸(cfDNA)的5’端断点处比对至参考基因组上的位置向上游间隔n个bp碱基后延长k个bp而获得的3’end motif的碱基序列集合。本申请发明人在长期研究中发现游离脱氧核糖核酸(cfDNA)片段3’端固定长度碱基序列集合即3’end motif变化也将体现出不同核酸酶活性的变化,能够成为确定生物体病状的新的生物标志物,与5’end motif和breakpoint motif一起完善游离脱氧核糖核酸(cfDNA)片段末端序列特征体系。并且与5’end motif和breakpoint motif相比,3’end motif作为确定生物体病状的基因标志物,有着更加优秀的分类效果。
技术关键词
碱基序列数据
脱氧核糖核酸
基因
诊断试剂盒
计算机存储设备
样本
输入模块
分类器模型
输出模块
生物标志物
待测对象
序列特征
断点
风险
频率
算法
系统为您推荐了相关专利信息
染色体
联合优化方法
遗传算法求解
参数
数学模型
探针
连锁SNP位点
基因组变异数据
评估芯片
染色体
野生大黄鱼
甄别方法
SNaPshot技术
标记
分子
试剂盒
位点
热稳定DNA聚合酶
脱氧核糖核苷三磷酸
引物
反义寡核苷酸
药物
转基因小鼠
生物医药技术
细胞移植