基于分子特征与机器学习的线粒体毒性预测方法

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基于分子特征与机器学习的线粒体毒性预测方法
申请号:CN202411466899
申请日期:2024-10-21
公开号:CN118969125A
公开日期:2024-11-15
类型:发明专利
摘要
本发明涉及计算毒理学领域,公开了一种基于分子特征与机器学习的线粒体毒性预测方法,包括:获取对线粒体有毒或无毒的化合物数据;对采集数据集进行预处理;计算化合物的分子指纹和分子描述符,并耦合降维;将特征数据集分为训练集和测试集,构建基于树的机器学习模型和基于距离的机器学习模型,进行模型训练和基于权重集成不同类型模型;测试集数据带入模型进行预测,并评估选取最优的组合作为化合物线粒体毒性预测模型;计算线粒体毒性预测模型的应用域并对模型机理进行解释性分析。本发明可以预测小分子化合物是否具有线粒体毒性及毒性机理,相较于现有的QSAR预测方法,预测准确率和召回率更高,模型更为可靠。
技术关键词
毒性预测方法 机器学习模型 指纹 梯度提升机 描述符 数据 小分子化合物 朴素贝叶斯 随机梯度下降 机器学习算法 工作特征 支持向量机 随机森林 训练集 指标 配体 参数 混合物 单体
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