摘要
本发明涉及生物医学技术领域,具体公开了一种基于程序性细胞死亡特征基因的头颈部肿瘤预后和治疗反应预测模型的构建方法和应用。本发明利用头颈部肿瘤相关的scRNA‑seq数据集数据,基于目前已知的细胞死亡模式相关的基因,通过差异表达分析,获得在头颈部肿瘤中的细胞死亡模式相关的差异表达基因;在此基础上筛选出与头颈部肿瘤预后显著相关的表征头颈部肿瘤的程序性细胞死亡的特征基因;由此构建了头颈部肿瘤相关风险评分CDRscore模型;进一步通过独立验证集证实CDRscore模型的有效性,并使用喉鳞癌组织的空间转录组测序验证CDRscore模型中10个基因的分布。因此CDRscore可以作为预测术后预后和免疫治疗反应的新指标,这将协助结人头颈部肿瘤的临床治疗决策。
技术关键词
肿瘤
差异表达基因
差异表达分析
风险评分模型
机器学习语言
基因检测试剂
预测装置
综合数据库
生物医学技术
转录组测序
模式
输出模块
喉鳞癌
组织
数据获取模块
样本
数值