基于S-EPTS/LM-PCR的检测CRISPR-Cas9基因编辑系统脱靶效应的方法

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基于S-EPTS/LM-PCR的检测CRISPR-Cas9基因编辑系统脱靶效应的方法
申请号:CN202411476627
申请日期:2024-10-22
公开号:CN119649900A
公开日期:2025-03-18
类型:发明专利
摘要
本发明属于生物信息领域,具体涉及基于S‑EPTS/LM‑PCR的检测CRISPR‑Cas9基因编辑系统脱靶效应的方法,所述方法是在GUIDE‑seq方法的基础上,使用S‑EPTS/LM‑PCR替换PCR。本发明具有如下有益效果:1)通过引入S‑EPTS‑PCR技术,优化了PCR扩增条件,显著提高了对低频脱靶事件的检测能力,达到了增强检测灵敏度的效果;2)通过开发先进的生物信息学算法,实现了对多个靶点脱靶事件的准确区分和归因,达到了深入理解脱靶机制的效果;3)针通过综合分析工具的开发,提供了编辑框大小、可视化展示以及脱靶位点是否在癌相关基因上等详细信息,达到了显著提升临床应用价值的效果。
技术关键词
Cas9基因 脱靶效应 编辑系统 带接头 脱靶位点 PCR技术 分析工具 引物 生物素 归因 超声波 磁珠 基础 机制 算法
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