基于分组的蛋白质序列聚类方法及系统

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基于分组的蛋白质序列聚类方法及系统
申请号:CN202411487177
申请日期:2024-10-24
公开号:CN119007838B
公开日期:2024-12-17
类型:发明专利
摘要
本发明涉及蛋白质序列聚类技术领域,公开了基于分组的蛋白质序列聚类方法及系统;方法包括:对第i个待聚类的蛋白质序列进行分割,得到若干个蛋白质子序列,对每个蛋白质子序列,均采用第j种哈希函数进行哈希映射,得到每个蛋白质子序列对应的哈希值;选择哈希值中的最小值,作为MinHash值;得到序列在M种哈希函数下的MinHash值;进而得到N个待聚类的蛋白质序列在M种哈希函数下的MinHash值;在每一种哈希函数下,遍历所有待聚类的蛋白质序列所对应的MinHash值,将值相同的待聚类的蛋白质序列划入同一个分组中;对每个组内的蛋白质序列进行聚类得到聚类结果。在降低计算复杂度的同时,保持聚类结果的准确性。
技术关键词
序列聚类方法 通用哈希函数 滑动窗口 队列 节点 聚类系统 聚类技术 标识符 树状结构 模块 哈希算法 元素 种子 编码 复杂度 字符 基础 尺寸
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沪ICP备2023015588号