摘要
本发明涉及生物技术领域,尤其涉及抗菌肽的筛选模型及其应用,该筛选模型通过如下步骤构建:模型特征参数识别,提取七个影响抗菌肽序列抗菌活性的特征,七个特征分别为序列长度、电荷、疏水性、α螺旋倾向性、两性、疏水矩和L型氨基酸比例;利用机器学习模型和设定的阈值,对具有抗菌活性的抗菌肽序列进行筛选,当七个特征的综合评分大于设定的阈值时,判定抗菌肽序列具有抗菌活性。将该筛选模型应用于具有抗菌/抑菌活性益生菌菌株的筛选上,能够成功地筛选出具有抗菌/抑菌活性的益生菌菌株,有望在益生菌的研究和开发领域取得广阔的应用前景和卓越的商业价值。
技术关键词
抗菌肽
机器学习模型
梯度提升决策树
益生菌菌株
序列数据处理
正电氨基酸
鼠李糖乳杆菌
水性
活性益生菌
长双歧杆菌
抑菌药物
深度神经网络
支持向量机
重复序列
随机森林
带正电
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