一种适应宿主脓肿分枝杆菌基因组生信鉴定方法及试剂盒

本专利属于病原微生物基因组生物信息分析领域，具体涉及一套脓肿分枝杆菌适应人类宿主特异基因的生物信息学鉴定流程及其应用试剂盒。脓肿分枝杆菌在环境中无处不在，是机会性致病菌。随着循环克隆(dominant circulating clones,DCC)和新兴循环克隆(emerging circulating clones ECC)脓肿分枝杆菌的出现提示其逐步从在环境中广泛存在的条件致病菌演进为适应人类宿主致病菌。本专利提供了一套鉴定脓肿分枝杆菌适应人类宿主特异基因的生物信息学和分子生物学流程。另外本专利涉及脓肿分枝杆菌特异适应宿主的30个基因，包括抗生素耐药性(eis2、erm(41)和gyrA)、细胞壁(ubiA和embC)、双组分系统(phoP和phoR)、全局调节因子(crp和espR)和金属离子调节(der和ideR)等。