一种基于全卷积注意力机制神经网络的硒肽从头测序方法

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推荐专利
一种基于全卷积注意力机制神经网络的硒肽从头测序方法
申请号:CN202411532777
申请日期:2024-10-30
公开号:CN119479810A
公开日期:2025-02-18
类型:发明专利
摘要
本发明提供了一种基于全卷积注意力机制神经网络的硒肽从头测序方法,属于含硒天然多肽鉴定检测领域,以所有硒肽中每个特征片段对应的具体硒代氨基酸为起始氨基酸,之后依次预测N/C端方向下一个的符号,以最高概率的符号为对应位置的符号;用全卷积注意力机制神经网络学习已知硒肽序列中硒肽N、C端氨基酸特征,之后进行特征融合,标准化到0到1;以所有鉴定的硒肽序列为输入层,用神经网络隐藏层的激活函数进行数据特征分离,计算每个分离特征,获取对应硒肽序列为天然硒肽的概率,去掉不匹配的硒肽序列,输出层输出鉴定的天然硒肽序列;优化模型的权重和偏置,将所有鉴定的硒肽序列输入到优化模型中,当与真实序列间的误差不再变化时,得到测序模型,将待测样品的所有硒肽相应鉴定的硒肽序列输入到测序模型中,得到待测样品所鉴定的天然硒肽序列。
技术关键词
注意力机制 序列 硒代氨基酸 符号 数据 误差 同位素 矩阵 质谱 多肽 离子 算法 元素 网络
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沪ICP备2023015588号