一种蛋白质与小分子结合常数预测的方法与存储介质

本发明公开了一种蛋白质与小分子结合常数预测的方法与存储介质。预测方法包括如下步骤：获取蛋白质的氨基酸序列、小分子的SMILES字符串和蛋白质与小分子之间的结合常数，并将三者组成的预训练数据集输入不同的大语言模型中，并筛选获得基座大语言模型；采用LoRA微调基座大语言模型；优化生成任务中的参数；基于微调后的基座大语言模型和优化后的参数获得预测模型；将待预测的蛋白质的氨基酸序列和小分子的SMILES字符串输入预测模型，输出结合常数。本发明是将生物分子转变为化学语言模式，并且需要同时输入配对的氨基酸序列的字符和小分子的SMILES才可进行推断。本发明可以为药物筛选提供一个决策工具。