摘要
本发明公开了一种检测植物突变体染色体重排的方法,属于植物基因检测技术领域。本发明针对植物突变体染色体结构变异开发了一种基于BSA重测序和PCR扩增的检测手段,包括混池的构建和二代测序、高质量变异位点挖掘、区间定位、目的基因定位及染色体重排检测及验证等步骤。优点在于能以成本较低的二代测序技术快速、精准地定位突变基因并检测与之关联的染色体重排事件,有效弥补了目前基于二代基因组测序数据检测染色体结构变异算法无法识别大片段插入和更复杂的染色体重排事件的缺陷。
技术关键词
位点
突变体表型
原始测序数据
检测染色体结构
基因组测序数据
二代测序技术
序列
基因检测技术
软件
带接头
引物
模块
算法
频率