摘要
本发明公开了一种基于孪生神经网络的多视图分子对活性预测方法和装置,包括:构建包含蛋白质靶标的分子对活性数据集;分别提取两个分子的初始嵌入表示和蛋白质靶标的初始嵌入表示;构建具有孪生神经网络架构的多视图分子对活性预测模型;利用每对分子对活性数据对多视图分子对活性预测模型进行预训练任务和微调任务的参数优化;使用参数优化后的多视图分子对活性预测模型进行分子对活性预测。该方法和装置通过多视图分子对活性预测模型获取分子内相互作用表征和蛋白质‑配体分子间的相互作用表征,并利用孪生神经网络学习分子对间的活性差异,最终实现对分子活性的高效、精准预测,以用于更好地指导先导化合物优化。
技术关键词
孪生神经网络
活性预测方法
分子内相互作用
局部特征提取
蛋白质间相互作用
靶标
特征提取模块
全局特征提取
多层感知机
注意力
非线性
数据
参数
先导化合物
预测装置
处理器
可读存储介质
存储器