一种黑色素瘤抗PD-1免疫治疗反应预测基因对的建立和验证方法

本发明公开了一种黑色素瘤抗PD‑1免疫治疗反应预测基因对的建立和验证方法。选定黑色素瘤抗PD‑1免疫治疗数据集作为训练集，采用基于样本内基因相对表达秩次关系的方法形成基因对矩阵，筛选候选预测基因对。基于候选预测基因对，采用贪婪算法来寻找具有最大样本覆盖率的基因对组合，筛选预测效能最好的基因对组合作为预测基因对。针对一个待预测样本，计算预测基因对组合中genea>geneb的基因对数。根据投票规则，若genea>geneb的基因对数过半，则可将待预测样本分类为有响应的样本，反之为无响应的样本。并在其他不同平台的样本验证集中得到验证。