摘要
本发明提出了一种基于代谢计算模型预测促进微生物生长所需营养添加剂质的方法,包括获取或构建目标微生物的基因组规模代谢网络模型,其描述了微生物细胞内的代谢网络,并计算代谢物的流量及生长速率。通过收集酶的分子量(MW)和kcat值,设定细胞蛋白浓度和代谢蛋白比例,引入酶动力学和蛋白质池数据约束,增强了模型的准确性。利用受约束的模型,设定不同营养添加剂的交换反应及其摄取速率,计算补充剂特定效率(SSE)指标,并预测添加营养添加剂后微生物的最大生长速率,从而评估营养添加剂对提高微生物生长速率的效率。该方法用于预测和评估促进微生物生长所需的营养添加剂,显著提高了预测微生物对营养添加剂响应的准确性。
技术关键词
营养添加剂
速率
补充剂
蛋白质编码基因
数据
基因组分析
模型预测值
机器学习算法
纤维二糖
计算机程序产品
因子
指标
网络
矩阵
分区
定义
比率