一种用于准确蛋白质二级结构预测的多任务学习框架

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一种用于准确蛋白质二级结构预测的多任务学习框架
申请号:CN202411811809
申请日期:2024-12-10
公开号:CN119724360A
公开日期:2025-03-28
类型:发明专利
摘要
本发明属于生物信息技术领域,特别涉及一种用于准确蛋白质二级结构预测的多任务学习框架。本发明设计强针对性自编码器(HTA)作为驱动,对序列进行与同源蛋白无关的编码,以提升蛋白质二级结构的三态和八态预测性能。在HTA生成的强针对性编码特征中,能够降低同源蛋白的干扰并提升特征空间利用率。其次,在生物知识的指导下,本发明提出基于多任务学习策略的蛋白质二级结构预测模型(PSSP‑MTL)。PSSP‑MTL模型能够灵活平衡全局和多尺度局部特征,并且基于多门混合专家结构实现多任务间的充分信息交换。
技术关键词
蛋白质二级结构 输出特征 参数 时序卷积神经网络 滤波器 卷积模块 蛋白质一级结构 多任务学习策略 序列 融合特征 嵌入特征 编码特征 框架 生物信息技术 多尺度 双曲正切函数 门控循环单元
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