一种预测小分子与蛋白质相互作用关系的处理方法和装置

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一种预测小分子与蛋白质相互作用关系的处理方法和装置
申请号:CN202411816279
申请日期:2024-12-11
公开号:CN119763681A
公开日期:2025-04-04
类型:发明专利
摘要
本发明实施例涉及一种预测小分子与蛋白质相互作用关系的处理方法和装置,所述方法包括:构建相互作用预测模型;从公开数据集中收集小分子与蛋白质信息,并对收集到的任意一对小分子与蛋白质的相互作用模式图和整体相互作用强度进行标注,并基于收集信息和标注信息构建第一数据集;并对每个收集到的蛋白质做多次蛋白质变体拓展从而得到多个第二数据集;先基于所有第二数据集对模型的蛋白质特征提取模块进行单、双模态训练,再基于第一数据集训练模型;模型训练结束后利用相互作用预测模型处理预测任务。通过本发明可以提高预测效率,可以在蛋白质模态缺失的情况下完成预测。
技术关键词
蛋白质特征提取 分子 序列 特征向量空间 双模态 优化器 数据 强度 编码器 跨模态 特征提取模块 输入端 编码向量 关系 参数 模式 标签 样本 模型训练模块
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