摘要
本发明提供了一种基于几何表征的药物靶点相互作用方法,包括:使用几何增强图神经网络GeoGNN从药物结构图中获取药物结构特征;使用几何编码器从靶点结构图中获取靶点结构特征;将药物综合相似性、靶点综合相似性和药物靶点关联矩阵相结合构成异构网络,利用图神经网络GCN对异构网络进行特征提取,得到药物网络特征和靶点网络特征;将药物结构特征和药物网络特征、靶点结构特征和靶点网络特征分别进行多模态特征融合;从融合后的药物多模态特征和融合后的靶点多模态特征中提取药物和靶点之间的交互信息;基于交互信息,得到更好的药物和靶点的特征,通过分类器预测药物和靶点之间的相互作用概率。本发明提高了药物靶点相互作用预测准确度。
技术关键词
网络特征
药物
矩阵
多模态特征融合
指纹
序列
亲和力
共价键
融合特征
异构
编码器
分类器
注意力机制
元素
坐标
算法
节点