一种基于生物医学知识图谱和Transformer的药物协同作用预测方法

一种基于生物医学知识图谱和Transformer的药物协同作用预测方法，它涉及一种药物协同作用预测方法。本发明为了解决传统的药物组合发现过程主要依赖于临床试验，不仅费时费力，而且成本高，患者也存在风险的问题。本发明的步骤包括提取药物数据样本，生成数据集，划分训练和测试集，进行网络训练和测试；构造生物医学知识图谱；利用Rdkit将药物结构的序列表示转换成图；利用多跳子图挖掘网络挖掘知识图谱的子图；使用关系感知Transformer学习知识网络和药物分子图的特征表示，并进行融合；使用多层感知机进行药物对之间的协同作用预测；将训练集中的药物对输入到上述模型；将测试集中的药物对输入到预测模型中，得到预测结果。本发明属于药物协同作用预测技术领域。