一种基于深度学习的CRISPR/Cas9介导的DNA双链断裂修复结果预测方法

本发明公开了一种基于深度学习的CRISPR/Cas9介导的DNA双链断裂修复结果预测方法，包括：（1）构建数据集，从公开数据库获取DNA序列数据集。（2）构建Token字典，用于将DNA序列编码数字序列。（3）构建输入序列，将DNA序列进行扫描，得到1‑mer和3‑mer子序列，再将其拼接，最后通过Token字典，编码成数字序列用于模型输入。（4）基于深度学习设计ECnnIndel方法，预测CRISPR/Cas9编辑结果。（5）对于待测的DNA序列，通过上述步骤将其编码成数字序列，输入已训练的ECnnIndel模型中，分析ECnnIndel的泛化性能。采用本发明有效解决设备资源不足，精度低等缺点，ECnnIndel促进了计算机辅助双链DNA断裂修复机制研究进展。