摘要
本发明公开了一种基于靶向基因型检测技术的花鲈液相芯片及其应用,本方案芯片可检测45,459个目标位点的基因型,其包括44,927个均匀分布于全基因组的背景SNPs位点、454个位于编码区且可导致移码突变的INDELs位点及78个与花鲈生长相关功能位点。该芯片基于液相探针杂交的靶向测序基因型检测技术(GBTS),相比于目前已有的花鲈基因分型方法,本方案提供的液相芯片在目标位点检测的可重复性和准确率以及实验标准化程度、数据分析简易程度和所需计算资源等方面具有极大的优势。本发明填补了花鲈缺乏基因分型芯片的空白,适用于花鲈的基因组选择育种、全基因组关联分析、种质鉴定及遗传多样性分析。
技术关键词
花鲈
位点
液相
遗传多样性分析
检测单核苷酸多态性
种质鉴定
构建DNA文库
样品全基因组
全基因组关联分析
基因分型芯片
探针
次要等位基因
基因分型方法
二代测序技术
评估芯片
复合物
标记
生物素