一种超高通量药物小分子虚拟筛选方法、存储介质及设备

本发明涉及一种超高通量药物小分子虚拟筛选方法、存储介质及设备，所述方法包括：获取目标蛋白结构和待筛选的小分子化合物库，从小分子化合物库初步筛选获得第一小分子化合物集；采用至少两种以上复选工具从第一小分子化合物集中筛选获得第二小分子化合物集；对目标蛋白结构进行分子动力学模拟，从分子动力学模拟轨迹中提取多种代表性构象，基于代表性构象从第二小分子化合物集中筛选获得第三小分子化合物集；对第三小分子化合物集进行聚类分析，选择具有代表性的小分子化合物，作为候选化合物；选择结合自由能较低的化合物作为最终筛选结果。与现有技术相比，本发明具有能够提高新药开发过程中小分子化合物筛选的效率和精度等优点。