摘要
本发明公开了一种基于图神经网络与卷积神经网络的药物反应预测方法,属于药物反应预测技术领域,包括以下步骤:S1:数据预处理;S2:网络构建;S3:网络训练;S4:药物反应预测。本发明采用了卷积神经网络与图神经网络结合的方法,加入了药物分子图数据,引入了药物分子的结构特征,使得最终的回归预测更佳精准;对于来源于序列的药物分子指纹全局特征使用堆叠的一维卷积模块进行特征提取,强化了邻域信息;通过设计的信息交互融合分支,不仅实现了对药物特征与细胞系特征的信息交互,同样实现了药物反应信息与药物smiles序列信息之间的交互,得到的新特征向量提高了模型的预测性能。
技术关键词
药物
细胞系
矩阵
二维卷积神经网络
多层感知机
全局特征提取
指纹
分支
分子
实体
融合特征提取
图谱
靶标相互作用
拼接模块
注意力机制
卷积模块
基因表达数据
序列