摘要
本公开提供一种基于检测的细粒度蛋白酶功能预测方法。首先,将初始输入蛋白质序列送入预训练好的ESM‑1b编码器得到通用初始嵌入式特征,构建基于编码器‑解码器结构的酶功能预测模型,包含蛋白质残基编码器和酶功能解码器;而后采用基于二分图匹配的模型训练方式对模型进行训练优化;之后构建基于注意力机制的功能特异性酶活性位点标注方法,在预测酶功能的同时定位出在酶促反应中重要的功能位点;模型最终实现对于单功能酶预测和多功能酶预测任务,并且根据预测结果进行有解释性的酶促反应活性位点标注。最终实现建立蛋白质结构与功能之间的联系。
技术关键词
功能预测方法
位点
蛋白酶
标注方法
多功能酶
解码器结构
嵌入特征
交叉注意力机制
线性分类器
编码器结构
匈牙利算法
标签
信息编码
序列
代表
系统为您推荐了相关专利信息
数据挖掘分析方法
抗体
促甲状腺激素受体
基因扩增产物
序列
肺炎支原体肺炎
检测肺炎支原体
RNA编辑位点
标志物
寡核苷酸探针
集成特征选择方法
位点
隐马尔可夫模型
机器可读指令
图形化操作界面