基于深度双曲流形嵌入的细胞分化轨迹推断方法

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基于深度双曲流形嵌入的细胞分化轨迹推断方法
申请号:CN202510044838
申请日期:2025-01-13
公开号:CN119479828B
公开日期:2025-11-04
类型:发明专利
摘要
本发明涉及基于深度双曲流形嵌入的细胞分化轨迹推断方法,包括:获取单细胞RNA测序数据;引入负曲率的双曲空间嵌入,通过深度特征提取网络对所述单细胞RNA测序数据进行特征提取,并将提取的高维特征映射到低维双曲空间;通过低维双曲空间中的轨迹推断,构建细胞从祖细胞到各分化终末细胞类型的转变路径,并利用敏感性分析方法评估关键基因和通路。本发明的有益效果是:本发明通过引入负曲率的双曲空间嵌入,模型能够更好地捕捉数据的层次结构,增强分化轨迹的准确性和一致性。并且,本发明能够处理高维单细胞测序数据,克服传统方法在高维情况下的局限性,提升模型的适用性。
技术关键词
深度特征提取网络 敏感性分析方法 推断方法 轨迹 祖细胞 计算机存储介质 层次聚类算法 基因 推断系统 数据 重构 电子设备 模块 存储器 处理器 信号
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