一种环境RNA病毒的组学分析方法

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推荐专利
一种环境RNA病毒的组学分析方法
申请号:CN202510118509
申请日期:2025-01-24
公开号:CN119920323B
公开日期:2025-11-11
类型:发明专利
摘要
本发明涉及一种环境RNA病毒的组学分析方法,具体地,本发明提供了对样品中RNA病毒进行分析的方法,其包括以下步骤:1)对样品进行宏转录组测序获得宏转录组学数据,然后通过基于RdRp的同源迭代法和基于机器学习模型的geNomad法对宏转录组学数据进行分析,筛选样品中的RNA病毒序列,获得RNA病毒操作分类单元及其序列;2)将步骤1)获得的RNA病毒操作分类单元分别进行丰度分析、分类鉴定和宿主分析;其中,所述分类鉴定包括通过geNomad、CAT两种方法分别对RNA病毒操作分类单元序列进行分析,获得样品中RNA病毒操作分类单元的分类结果。本发明的方法可为环境中RNA病毒的检测和分析提供方法技术,具有重要的现实意义。
技术关键词
病毒 转录组学 宏转录组 序列 机器学习模型 分析方法 现实意义 堆肥 数据 污泥 水体 软件
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