摘要
本发明涉及一种环境RNA病毒的组学分析方法,具体地,本发明提供了对样品中RNA病毒进行分析的方法,其包括以下步骤:1)对样品进行宏转录组测序获得宏转录组学数据,然后通过基于RdRp的同源迭代法和基于机器学习模型的geNomad法对宏转录组学数据进行分析,筛选样品中的RNA病毒序列,获得RNA病毒操作分类单元及其序列;2)将步骤1)获得的RNA病毒操作分类单元分别进行丰度分析、分类鉴定和宿主分析;其中,所述分类鉴定包括通过geNomad、CAT两种方法分别对RNA病毒操作分类单元序列进行分析,获得样品中RNA病毒操作分类单元的分类结果。本发明的方法可为环境中RNA病毒的检测和分析提供方法技术,具有重要的现实意义。
技术关键词
病毒
转录组学
宏转录组
序列
机器学习模型
分析方法
现实意义
堆肥
数据
污泥
水体
软件