摘要
本发明公开了一种基于环境DNA技术对白氏文昌鱼进行生物量评估的特异性引物和探针、试剂盒及其应用,涉及生物技术领域。所述引物包括上游引物F:5’‑TGGGAATTGATTAGTGCCTATGATG‑3’,如序列表SEQ ID NO:1所示,下游引物R:5’‑GATAAACAGTTCATCCAGTCCCC‑3’,如序列表SEQ ID NO:2所示,探针为CCAGCCTCGACAGCAGAAGAAGCCAA,如序列表SEQ ID NO:3所示。本发明成功地利用荧光定量PCR法绘制了白氏文昌鱼DNA浓度与Ct值的标准曲线,据此测定了不同白氏文昌鱼群体密度环境下的水体样品中的eDNA,且首次构建白氏文昌鱼eDNA浓度与其生物量之间关系的数学模型,为开展野外白氏文昌鱼生物量、种群密度的评估及其分布现状的调查提供了技术支撑和理论依据,有利于对白氏文昌鱼的野外濒危程度进行等级划分,对白氏文昌鱼的濒危程度评价及保护具有重要意义。
技术关键词
环境DNA技术
白氏文昌鱼
引物
探针
荧光定量PCR法
试剂盒
PCR扩增产物
琼脂糖凝胶电泳
质粒载体
曲线
水体
模板
数学模型
拷贝数
基团
样本
标记
密度
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序列
结直肠癌辅助诊断
特异性扩增引物
标志物
风险预测模型
序列
生物标志物
寡核苷酸探针
检测试剂盒
miRNA芯片
重组病毒载体
肝癌诊断试剂盒
核苷酸
基因芯片
引物
染色体
乌骨鸡
SNP位点基因型
朴素贝叶斯算法
试剂盒