一种基于遗传图谱筛选芯片标记的方法

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一种基于遗传图谱筛选芯片标记的方法
申请号:CN202510146216
申请日期:2025-02-10
公开号:CN120032712A
公开日期:2025-05-23
类型:发明专利
摘要
本申请提出一种基于遗传图谱筛选芯片标记的方法,首先获取基础SNP标记集合,包括多个非均匀分布的基础SNP标记以及物理位置;再将已知功能位点和参考基因组进行比对,得到多个必选标记;再根据遗传图谱将基础SNP标记集合转换为遗传SNP标记集合,遗传SNP标记集合至少包括基础SNP标记,以及与基础SNP标记对应的遗传位置;再根据设定遗传距离划分遗传SNP标记集合,得到多个标记区间;再判断各标记区间中是否有必选标记,若没有,则对该标记区间进行补充标记,得到芯片标记。本申请通过遗传位置划分,可进行更有针对性的遗传学分析,在遗传学上更加均匀。另外,本申请确保每个标记区间内包含与重要生物学功能相关的位点,保证芯片标记的有效性和可信度。
技术关键词
芯片标记 效应 冗余 基础 QTL位点 图谱 全基因组关联分析 搜寻策略 代表 定位点 核苷酸 有效性 物理 软件 数据
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