摘要
本发明属于分子标记辅助育种技术领域,具体涉及一种玉米4号染色体上白斑病抗性相关分子标记及应用,具体的,本发明提供与玉米白斑病抗性相关的分子标记,所述分子标记基因为Zm00001eb168510基因和/或如SEQ ID NO:1所示的序列,所述Zm00001eb168510基因的CDs序列如SEQ ID NO:2所示,本发明通过多年多点实验,在玉米4号染色体上共同定位到白斑病抗性QTL qMWS4‑4区间与抗性SNP:4‑14146725及其关联基因Zm00001eb168510,该SNP位点通过QTL连锁分析、GWAS关联分析均可在不同环境下定位到,可解释15.14%的表型变异;其关联的候选功能基因主要编码半胱氨酸蛋白酶超家族蛋白,半胱氨酸蛋白酶大家族中含有去泛素化酶,在植物发育和逆境应答中起重要作用。
技术关键词
全基因组关联分析
分子标记辅助
遗传多样性分析
玉米品种
TaqMan探针法
荧光原位杂交方法
位点
序列
染色体
标记基因
半胱氨酸蛋白酶
基因芯片
图谱
高通量
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单核苷酸多态性
聚类
样本
全基因组关联分析
头脑风暴算法
葡萄
全基因组关联分析
贝叶斯回归模型
混合线性模型
模型贝叶斯
辣椒材料
分子标记辅助
鉴定辣椒
核苷酸
基因芯片
地方鸡
种质资源鉴定
平武红鸡
旧院黑鸡
分子标记辅助
SNP位点组合
全基因组关联分析
寿命
探针
分析测序数据