摘要
本发明公开了一种基于虚拟图和多尺度特征的抗体偶联药物结合预测方法,其提出了药物载体、连接子、抗体重链和轻链、抗原靶蛋白初始特征构建方法,提出用1DCNN提取药物序列特征,设计了基于图虚拟节点的药物特征提取方法,在分子结构图引入了虚拟节点和虚拟边,以Graph Transformer作为图特征提取器,以虚拟节点特征作为药物表示,然后将蛋白质与药物特征输入到特征融合模块,特征融合中加入了注意力机制与门控跳跃连接机制,捕捉潜在交互作用的同时融合不同隐藏层的特征信息,实现更高精度亲和力预测。本发明能够解决现有方法抗体偶联药物结构特征难以提取的技术问题、以及不同组件的特征难以融合的技术问题。
技术关键词
抗体偶联药物
药物载体
序列
变换器
特征提取模块
节点
注意力
亲和力预测模型
拉普拉斯
结构特征提取
线性变换矩阵
编码器
数据
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